蛇口中學創建于1970年,開辦時定性為兩年制高中,當時校舍尚無,租借灣廈村的一間倉庫做為校舍,吳湛擔任校長,有3名教師,他們是殷干勛、徐志華、鄭耀輝,開設一個班,有29名學生。
蛇口學校在2003年由兩所廣東省一級學校--蛇口小學(創辦于1955年)和蛇口中學(創辦于1970年)合并而成的九年一貫制學校。校園面積3萬5千平方米,建筑面積2萬1千平方米?,F有59個教學班,其中小學部29個班,中學部30個班。學生人數2757人(其中小學部1389人、中學部1368人),教職工203人。有60間教室,操場1個,體育館1間,多媒體室6間,實驗室及科學探究室8間。